在HTML中嵌入JavaScript代码虽然没有问题，但一般认为最好的做法还是尽可能使用外部文件来包含JavaScript代码。不过，并不存在必须使用外部文件的硬性规定，但支持使用外部文件有如下优点。
- 可维护性：遍及不同HTML页面的JavaScript会造成维护问题。但把所有JavaScript文件都放在一个文件夹中，维护起来就轻松多了。而且开发人员因此也能够在不触及HTML标记的情况下，集中精力编辑JavaScript代码。
- 可缓存：浏览器能够根据具体的设置缓存链接的所有外部JavaScript文件。也就是说，如果有两个页面都使用同一个文件，那么这个文件只需下载一次。因此，最终结果就是能够加快页面加载的速度。
- 适应未来：通过外部文件来包含JavaScript无须使用前面提到XHTML或注释hack，HTML和XHTML包含外部文件的语法是相同的。